多重單堿基延伸SNP分型技術(shù)(multiplex SNaPshot)由美國應(yīng)用生物公司開發(fā)，主要針對中等通量的SNP分型項(xiàng)目。在一個含有測序酶、4種熒光標(biāo)記的ddNTP、緊挨多態(tài)位點(diǎn)5 7端的不同長度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中，引物延伸一個堿基即終止，經(jīng)AB測序儀跑膠后，根據(jù)峰的顏色可知摻人的堿基種類，從而確定該樣本的基因型，根據(jù)峰移動的膠位置確定該延伸產(chǎn)物對應(yīng)的SNP位點(diǎn)。對于PCR產(chǎn)物模板可通過多重PCR反應(yīng)體系來獲得。與其他SNP分型技術(shù)(RFLP、Taqman、SNPstream)相比，多重單堿基延伸SNP分型技術(shù)具有如下優(yōu)勢。①分型準(zhǔn)確，其準(zhǔn)確度僅亞于直接測序。②多位點(diǎn)同時檢測，可以同時檢測達(dá)12個位點(diǎn)，而RFLP及Taqman -次僅能檢測一個。③不受SNP位點(diǎn)多態(tài)特性限制，不管該位點(diǎn)是G/C、AlT、G/A、C／T還是插入／缺失多態(tài)，都可以放在一個體系中檢測。④不受樣本量的限制。⑤可以檢測出受污染的樣本，如果一個樣本的分趔峰譜偏離正常的分布，它可以提示該樣本可能受到污染或濃度過低，而其他分型方法則不能做到這一點(diǎn)。
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